对于微生物采样器的选用，一般情况下主要从微生物采样器性能、采样目的和空气环境类型来考虑，下面我们详细来聊聊： 1.采样器性能
不同种类采样器性能也有较大的差异，采集空气微生物有一个佳效率范围。一般情况下，微生物采样器采集小粒子都有很高的效率。但表面微生物采样器(SAS)、孢子采样器和离心式采样器采集小粒子效率却很低。
室内空气微生物污染的程度是衡量室内空气质量好坏的重要参数之一，要求微生物采样器必须具有获得大的采样效率，以确保采集到的空气微生物在统计学上有显著性和代表性。将空气微生物收集在半固态的营养培养基上的撞击式采样器，采样浓度一般不应超过105 CFU/m³，否则会发生超载现象。同时，要求采样器的空气采样流量要稳定，这样才能确保采样性能稳定可靠。如果使用非恒流型采样器采样时，必须经常校准空气采样流量。
住宅、办公室、学校等一般生活、工作和学习场所，进行室内空气质量评价、研究空气细菌污染与在室内人数、劳动强度、通风量以及污染源的关系时，可考虑选用将空气微生物收集在半固态的营养培养基上的撞击式采样器。既能够反映出空气微生物的污染水平，又能够定出可吸人与非可吸人粒子上携带的微生物浓度，评价其粒度分布状况及潜在的致病危害程度。
实际的采样应用中，往往不能确切预知有关的空气微生物的种类和浓度的情况下，这时可考虑用多种采样器及多种分析方法联合测定。
2.采样的目的
应依据采样目的来选用微生物采样器。例如仅要求测定空气中的细菌总数，还是要求测定各种活的空气微生物，或者要求测定所有的微生物粒子，或者还需要进一步了解空气中携带微生物的微粒粒度大小的分布状态。根据上述各种采样目的，确定选用将空气微生物收集在液体介质中、固态培养基上或者滤膜上的微生物采样器。
3.空气环境类型
测试结果证明，不同的环境空气类型，在不同位置(有无污染源)、时间、季节和气候状态下，待采集的空气微生物在种类和污染程度上有很大差异。空气微生物粒度大小不一，差异也很大。细菌在0.5-1.0μm，真菌在3-100μm，许多真菌孢子粒径在1-5μm，病毒则为0.01-0.1μm。
在室内空气中带菌的可吸人粒子数(CFU/m3)可占50％-90％。空气微生物污染严重时，应当考虑不容易或者不会发生超载的采样器。
